Réseau mondial sur les maladies infectieuses et l’épidémiologie GIDEON: un programme mondial de diagnostic et d’informatique pour les maladies infectieuses

Réseau mondial sur les maladies infectieuses et l’épidémiologie GIDEON: un programme mondial de diagnostic et d’informatique pour les maladies infectieuses

Le réseau mondial des maladies infectieuses et d’épidémiologie GIDEON http: // wwwgideononlinecom se compose de modules Le premier est conçu pour générer une liste de diagnostic différentiel classé pour tout scénario de maladies infectieuses dans tous les pays. Le deuxième suit l’épidémiologie spécifique à chaque pays. une encyclopédie complète des médicaments anti-infectieux génériques et des vaccins, y compris une liste de & gt; Noms commerciaux Le quatrième produit une liste d’identification basée sur le phénotype des bactéries, des mycobactéries et des levures. Le programme fonctionne bien et sert de paradigme utile pour l’informatique sur le World Wide Web GIDEON est un programme éclectique qui peut répondre aux besoins des cliniciens, épidémiologistes et microbiologistes travaillant dans les domaines des maladies infectieuses et de la médecine géographique

Si l’on demandait de concevoir un système d’information utile sur les maladies infectieuses, qu’est-ce que l’utilisateur final aurait besoin? Un tel système serait complet et engloberait les caractéristiques cliniques et l’épidémiologie de toutes les maladies infectieuses dans tous les pays, tous les agents pathogènes humains et tous médicaments anti-infectieux et vaccins Le programme serait flexible, serait mis à jour «en temps réel» et permettrait la modification des données par le fabricant et l’utilisateur final. Les exigences supplémentaires incluraient la transmission et la reproduction faciles des données dans les réseaux institutionnels, modules de l’étudiant, et ceteraOn des principaux problèmes dans le développement d’un tel système est la disponibilité et la qualité des données réelles La liste des maladies « déclarables » varie considérablement d’un pays à l’autre, et les chiffres sont souvent éloignés , sous-déclaration du SIDA et du choléra ProMed-mail http: // wwwpromedmailorg et des sites Web similaires portent une richesse de fiable et données actuelles, mais ils citent souvent des documents publiés dans la presse non spécialisée

Réseau mondial des maladies infectieuses et d’épidémiologie Gideon

Bien que GIDEON ait été initialement commercialisé sous forme de système sur CD-ROM, un programme interactif complet peut désormais être consulté en ligne. Contrairement à la version disponible sur CD-ROM, la version Internet peut être utilisée sur n’importe quel ordinateur. pour ajouter des notes personnalisées par les utilisateurs dans leurs propres langues et alphabets Ces notes peuvent inclure des adresses et numéros de téléphone, les coûts des médicaments ou des tests de laboratoire, et une liste des épidémies locales et des cas, entre autres chosesGIDEON http: // wwwgideononlinecom se compose de modules: Diagnostic, qui est conçu pour l’aide à la décision ou la simulation de maladies; L’épidémiologie, qui consiste en grande partie en des fichiers texte sur le statut spécifique au pays des maladies infectieuses individuelles; Thérapie, qui est une encyclopédie à jour des médicaments anti-infectieux et des vaccins; Diagnostic Le module Diagnostic est conçu pour générer un diagnostic différentiel sur la base des signes, des symptômes, des tests de laboratoire, de la période d’incubation et du pays d’origine de la maladie. Options dans l’écran de saisie des données sont organisées par système de corps, pays d’acquisition de la maladie et détails d’exposition. La zone inférieure « notes personnelles » sert à enregistrer des données de cas supplémentaires, et les notes peuvent être écrites dans la langue de l’utilisateur. inclure un rapport papier ou électronique, la génération d’un tableau comparant les caractéristiques cliniques des maladies énumérées, et des requêtes concernant l’omission ou le classement de maladies spécifiques Si l’utilisateur clique sur un nom de maladie, d’autres écrans décrivent la maladie elle-même et son épidémiologie clinique

Figure Vue largeTélécharger la diapositiveGlobal Infectious Diseases and Epidemiology Network Écran de saisie des données GIDEON Disponible sur: http://www.gideononlinenet/web/diagnostic/indexphpFigure View largeTélécharger la diapositiveGlobal Infectious Diseases and Epidemiology Network Écran de saisie des données GIDEON Disponible sur: http: // wwwgideononlinenet / web / diagnostic / indexphp La liste de diagnostic différentiel dans GIDEON est basée sur une formule bayésienne qui compare le produit mathématique de l’incidence de la maladie au taux de survenue de symptômes pour toutes les maladies infectieuses pertinentes dans un pays donné. des diagnostics différentiels complets d’éosinophilie et de splénomégalie ou d’arthralgie avec éruption Une option «bioterrorisme» produit le diagnostic différentiel des signes et symptômes associés à des scénarios de bioterrorisme suspectés Cette dernière option ne repose pas sur une formule bayésienne, car le concept de incidence « n’est pas pertinent Comme le soulignent les fabricants, le module ne doit pas se substituer au sens clinique et doit être considéré comme un système «expert» ou «d’aide à la décision» effet. Dans de nombreux cas, le diagnostic correct apparaît en premier sur la liste de GIDEON. une étude aveugle des cas menée par le développeur de GIDEON, le diagnostic correct est apparu dans le diagnostic différentiel en% des cas et a été classé premier en% Une étude ultérieure, qui a examiné les patients hospitalisés, a trouvé que le Pour cette raison, une option «pourquoi pas» a été ajoutée à GIDEON pour analyser pourquoi certains diagnostics ne sont pas listés. Il est important de se classer dans la performance des systèmes experts. En, Kassirer a constaté que les programmes d’aide à la décision médicale étaient souvent inadéquats lorsqu’il s’agissait de classer la maladie correcte comme «numéro un» dans une liste de diagnostics différentiels, mais il a également noté que la liste elle-même est utile pour rappeler le clinicien des maladies alternatives qui pourraient autrement ont été ignoréesEpidemiology Le module d’épidémiologie suit le statut global et spécifique au pays des maladies infectieuses génériques dans les pays Le fabricant déclare que la version actuelle contient & gt; La totalité du contenu de GIDEON provient de ministères de la santé, d’agences militaires, de listes Internet dédiées, par exemple pour la rage et l’anthrax, de journaux d’examen par les pairs, de textes standard et de données présentées à conférences majeures L’utilisateur peut également accéder à & gt ;, graphiques qui notent l’incidence, la prévalence et d’autres données numériques concernant l’état de la maladie au niveau mondial et spécifique au pays. Le texte bleu de la figure indique la disponibilité d’un graphique contextuel d’incidence

Figure Vue largeTélécharger la diapositiveNote spécifique au pays Le script bleu indique la disponibilité d’un graphique contextuelFigure Vue largeTélécharger la diapositiveNote spécifique au pays L’écriture bleue indique la disponibilité d’un graphique instantanéLes sous-modules présentent l’épidémiologie descriptive et les caractéristiques cliniques de chaque maladie. et des liens vers des sites Web pertinents Un certain nombre d’onglets «synonymiques» permettent à l’utilisateur d’accéder à ce matériel par le biais de termes alternatifs de maladies et de pays, y compris les noms de maladies en espagnol, allemand et français, entre autres langues. Par exemple, l’incidence annuelle de la variole au Japon est enregistrée depuis le dernier cas signalé dans le module As du module Diagnostic, les utilisateurs peuvent développer ces notes avec des données pertinentes pour leurs propres institutions et dans leur propre langue. option dans le module d’épidémiologie génère une liste de maladies com Patient avec des paramètres choisis par l’utilisateur Par exemple, l’utilisateur peut accéder à des informations sur les maladies trématodiques acquises chez les poissons au Japon, les Togavirus des États-Unis ou les agents pathogènes trouvés dans les marsupiaux australiens. Le module Thérapie suit la pharmacologie et l’utilisation de tous les médicaments et les vaccins utilisés dans le domaine des maladies infectieuses La version actuelle contient des agents génériques Une section énumère le mécanisme d’action; dosages pour les adultes, les enfants et les nourrissons; demi-vie d’élimination et métabolisme; les niveaux trouvés dans la bile, le LCR et le lait maternel; Suggestions d’ajustements posologiques pour la dysfonction rénale et la dialyse Autres sections listent les toxicités et les interactions médicamenteuses contre-indications et rappels pour les vaccins, dénominations brevetées, spectres incluant les recommandations des médicaments de choix et les normes de tests de sensibilité Listes internationales des synonymes contenant & gt; Les noms commerciaux permettent à l’utilisateur d’accéder au nom générique de toute préparation. D’autres sections permettent à l’utilisateur d’accéder à une liste de médicaments associés à une toxicité, une interaction médicamenteuse ou une indication thérapeutique donnée. les médicaments peuvent être utiles pour un patient souffrant à la fois de tuberculose et d’une surinfection à Pseudomonas, ou quels médicaments pourraient être utiles pour un enfant infesté par des espèces Capillaria, Strongyloides et ankylostomes. Comme dans d’autres modules, les utilisateurs peuvent ajouter des Le module Microbiologie est similaire à la fonction Diagnostic décrite ci-dessus, mais à la place des signes et des symptômes, l’utilisateur entre n’importe quelle combinaison de tests phénotypiques, et au lieu d’une liste de diagnostic différentiel, GIDEON génère un classement liste de probabilités de bactéries compatibles, par exemple, mycobactéries et levures La version actuelle incorpore des taxons Contrairement aux systèmes standard utilisés dans presque tous les laboratoires cliniques, cette liste est bayésienne, c’est-à-dire qu’elle utilise l’occurrence relative d’organismes pour déterminer la probabilité. Par exemple, si un ensemble de réactions phénotypiques est compatible avec Staphylococcus aureus et Staphylococcal hyicus, les systèmes d’identification automatisés et semi-automatiques attribuerait une probabilité de% à chacun et recommanderait des tests supplémentaires pour résoudre l’identification Avant d’insérer le nom de l’organisme en question dans l’un de ces systèmes, nous savons déjà intuitivement que S aureus est beaucoup plus susceptible que S hyicus d’être présent dans les spécimens cliniques et qu’une vraisemblance ne peut pas être correcte GIDEON est programmé pour ajuster la prévalence relative de la «probabilité a priori» de ces taxons, et il classerait S aureus en premier, avec une probabilité de & gt;% Options supplémentaires dans la Microbiologie le module peut être utilisé pour générer le phénotype complet, les noms antérieurs, l’écologie et l’association de la maladie pour un taxon donné, et ils peuvent produire un tableau qui compare les caractéristiques de toute combinaison de taxons sélectionnés par l’utilisateur Comme dans les autres modules, une liste de synonymes est disponible pour l’emplacement du nom actuel pour les désignations taxonomiques utilisées précédemment

Limitations du système

Bien que les fichiers texte GIDEON soient impressionnants en taille et en portée, il serait utile pour les versions futures de GIDEON d’inclure des tableaux, des cartes et du matériel photographique, par exemple des représentations de lésions cutanées ou de photomicrographies. Une autre limitation est liée au fait que le programme traite chaque pays comme une unité. Ainsi, le diagnostic différentiel de la pneumonie chez une personne américaine inclura la coccidioïdomycose et l’histoplasmose, même Si le patient vit à Hawaï ou en Alaska Ce problème est corrigé dans une large mesure par les notes spécifiques au pays et la base de connaissances générales du médecin traitant. En théorie, le fabricant pourrait suivre l’incidence de chaque maladie dans tous les États. États-Unis, Inde ou Venezuela, par exemple, district au Chili, ou province au Canada, mais la variabilité du terrain, en occ Les prix des réseaux institutionnels et des abonnements multi-utilisateurs sont basés sur le nombre d’utilisateurs Globalement, GIDEON est un programme utile qui utilise de façon optimale du World Wide Web, en ce qui concerne à la fois l’accès et la présentation des données pour la communauté des maladies infectieuses

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels SCE: no conflicts

Sylvie

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