L’effet du test de diagnostic moléculaire rapide sur les résultats cliniques dans les infections de la circulation sanguine: un examen systématique et une méta-analyse

L’effet du test de diagnostic moléculaire rapide sur les résultats cliniques dans les infections de la circulation sanguine: un examen systématique et une méta-analyse

Les méta-analyses visent à évaluer l’impact du mRDT dans l’amélioration des résultats cliniques dans BSIsMethods Nous avons recherché PubMed, CINAHL, Web of Science, et EMBASE jusqu’à mai pour Études BSI comparant les résultats cliniques entre la mRDT et les méthodes conventionnelles de microbiologieRésultats Trente et une études ont été incluses avec les patients Le risque de mortalité était significativement plus faible avec le mRDT qu’avec les méthodes conventionnelles de microbiologie odds ratio [OR],; % intervalle de confiance [IC], -, produisant un nombre de sujets à traiter Le risque de mortalité était légèrement plus faible avec le mRDT dans les études sur les programmes d’intendance des antimicrobiens ASPs,; Les études en% IC, – et non-ASP n’ont pas réussi à démontrer une diminution significative du risque de mortalité; – Des diminutions significatives du risque de mortalité ont été observées avec les deux groupes OR à Gram positif; % CI, – et les organismes gram-négatifs; – mais pas la levure; – Temps de traitement efficace diminué d’une différence moyenne pondérée de – heures% IC, – à – heures, et durée de séjour diminuée de – jours à joursConclusionsPour les BSIs, le mRDT a été associé à des diminutions significatives du risque de mortalité en présence d’un ASP, mais pas en son absence mRDT a également réduit le temps de traitement efficace et la durée de séjour mRDT devrait être considérée comme faisant partie de la norme de soins chez les patients atteints de bactériémies

Les bactériémies sont associées à des risques significatifs de morbidité et de mortalité et à une augmentation significative de la durée du séjour. LOS L’administration tardive d’antibiotiques efficaces augmente le risque de mortalité et donc la sélection correcte d’un traitement antibiotique L’identification différée de l’organisme causal et des susceptibilités de culture peut souvent être responsable des retards dans la thérapie antimicrobienne optimale Molecular rapide diagnostic de diagnostic mRDT, qui comprend des tests tels que la réaction en chaîne par polymérase PCR, la désorption laser assistée par matrice La spectrométrie de masse MALDI-TOF et l’hybridation in situ fluorescente PNA-FISH ont permis d’améliorer les méthodes microbiologiques conventionnelles, de réduire le temps nécessaire à l’identification des organismes, d’optimiser la thérapie antimicrobienne et d’améliorer les résultats cliniques, notamment: En outre, les lignes directrices du Programme de gestion des antimicrobiens de l’Infectious Diseases Society of America recommandent l’utilisation de tests de diagnostic rapide TDR avec ASP. Le soutien et l’intervention en complément des méthodes conventionnelles de prélèvement sanguin pour améliorer les résultats cliniques La mise en œuvre généralisée de cette technologie a été limitée en raison de résultats inadéquats et de coûts élevés Une méta-analyse récente comprenait des évaluations des bienfaits TDR phénotypique dans les BSIs mais limité par le temps de la littérature incluse, l’étude la plus récente étant publiée en En outre, l’impact sur la LOS n’a pas été évalué, ni l’effet sur le risque de mortalité selon la présence ASP. de cette revue systématique et méta-analyse était de fournir une évaluation complète et à jour de m Les effets du RDT sur le risque de mortalité, le délai avant l’instauration d’un traitement efficace et la durée du séjour, comparativement aux méthodes conventionnelles de microbiologie chez les patients atteints de bactériémie bovine

Méthodes

Recherche documentaire

Nous avons recherché PubMed, CINAHL, Web of Science et Embase du début à mai pour les études BSI en anglais comparant les résultats cliniques entre mRDT et les méthodes conventionnelles de microbiologie Nous avons utilisé la requête suivante: bactériémie ou «bloodstream infection» et spectrométrie ou «matrix assisted laser». MALDI-TOF ou microréseau ou PCR ou « acide nucléique » ou PNA ou moléculaire ou « polymérase en chaîne » et « durée de séjour » ou mortalité ou morbidité ou diagnostic ou résultat Deux auteurs TTT et JBM ont recherché dans la littérature Les références pour les articles inclus ont été recherchées manuellement pour identifier d’autres études pertinentes. Des études non publiées ont été incluses à travers la recherche de résumés d’IDWeek, la conférence Interscience sur les agents antimicrobiens et la chimiothérapie, et la Congrès de Microbiologie Clinique et Infe maladies céphaliques de à, en utilisant les mots-clés « bactériémie » ou « infection sanguine »

Sélection d’étude

Toutes les études évaluant les différences dans les résultats cliniques entre le mRDT, soit pour l’identification des organismes et / ou la détection des mécanismes de résistance, et les méthodes conventionnelles dans les bactériémies étaient éligibles à l’inclusion. Les études ont été exclues si elles étaient non anglaises, si elles ont évalué des infections par des organismes mycobactériens, viraux ou parasitaires, ou si elles ont appliqué le mRDT à des hémocultures négatives ou à des prélèvements sanguins directs, par exemple Septifast.

Résultats

Les risques évalués comprenaient le risque global de mortalité, le risque de mortalité dans les études avec ASP, le risque de mortalité par organisme, le délai de traitement efficace et la LOS. Le risque de mortalité était défini comme un risque de mortalité tous les jours ou à l’hôpital. Gram négatif, levure, ou, si une combinaison de ces éléments, plusieurs fois le temps de traitement efficace a été défini comme le temps de collecte d’un échantillon sanguin ou un résultat positif à un traitement avec une activité in vitro contre l’organisme infectant. Les études ont été classées comme des études ASP si les auteurs ont rapporté des maladies infectieuses revue par un médecin ou un pharmacien de la sélection antimicrobienne basée sur des résultats de culture ou de mRDT

Évaluations de la qualité

Des évaluations de la qualité ont été effectuées par les auteurs TTT et JBM en utilisant l’échelle de Newcastle-Ottawa pour les études observationnelles et l’outil Risk of Bias pour les essais contrôlés randomisés L’échelle de Newcastle-Ottawa évalue la sélection des patients, la comparabilité des patients et évaluation des résultats L’outil Risque de biais évalue si le biais est faible, élevé ou imprécis selon les principaux domaines de biais dans les essais contrôlés randomisés, y compris la sélection, la performance, la détection, l’attrition et le biais de déclaration. évaluation entre les auteurs ont été résolus par consensus impliquant un troisième auteur KWM

Extraction de données et analyse

Toutes les méta-analyses ont été réalisées à l’aide du logiciel Review Manager The Cochrane Collaboration, version Les résultats de mortalité ont été évalués en utilisant un modèle à effets aléatoires pour estimer les odds ratios groupés et les intervalles de confiance en pourcentage avec les poids décrits par DerSimonian et Laird. de l’essai en termes cliniques, le nombre nécessaire de traiter pour prévenir la mort a été calculé L’effet du DDRm à temps pour un traitement efficace et LOS a été évalué à l’aide d’un modèle à effets aléatoires et rapporté comme différence moyenne pondérée avec% IC médians et intervalles interquartiles Les biais de publication ont été évalués en utilisant des diagrammes en entonnoir et le test d’Egger. L’hétérogénéité entre les études a été évaluée avec une estimation I et le test de Cochran Q. Pour les tests d’hétérogénéité, les résultats ont été considérés significatifs à P & lt. ; , parce que le test Q a une faible puissance Les effets aléatoires méta-régressions univariées ont été effectuées pour des covariables ayant des effets possibles sur un résultat et ont été rapportées dans ≥ études, en utilisant le paquet de métaphores dans R software R Foundation for Statistical Computing l’examen et la méta-analyse ont été menés conformément aux éléments de déclaration préférés pour les examens systématiques et les méta-analyses Lignes directrices de PRISMA Tableau supplémentaire

RÉSULTATS

ental Hôpitaux communautaires Organismes adultes / Gram négatif Conventionnels vs MALDI-TOF NR; infirmière et ASP Oui En temps réel Ly et al RCT Centre de soins tertiaires lits Adultes / Staphylococcus spp Conventionnel vs PNA-FISH Deux fois par jour; médecin traitant Non SO NA Macvane et al Quasi expérimental NR Organismes adultes / Gram négatifs Conventionnelle vs PCR NR; RN Oui NR Macvane et al Quasi-expérimental Lits de centre académique Adulte / Enterococcus spp Conventionnel vs PCR ×; infirmier et pharmacien Oui En temps réel am- pm; M-F Maslonka et coll. Case-contrôle NR NR / Multiple conventionnel vs PCR NR; NR Non NA Na et al Quasi-expérimental Hôpital universitaire NR / Staphylococcus spp Conventionnel versus PCR Une fois par jour M-Sat; EHR seulement Non NA Nagel et al Quasi-expérimental Système de santé Adulte / CoNS conventionnel vs MALDI-TOF NR; médecin et ASP Oui am-: am Neuberger et al Quasi-expérimental Centre médical de soins tertiaires NR / Klebsiella pneumoniae Conventionnel vs PCR pm- am M-F; médecin Non NA Nguyen et al Hôpital universitaire quasi-expérimental Adulte / Staphylococcus spp Conventionnel vs PCR NR; EHR seulement Non NA Pardo et al Case-contrôle Lits médicaux académiques Adulte / Multiple Conventionnel vs PCR Une fois par jour; ASP Oui NR Perez et al Quasi-expérimental Quaternaire soins hospitaliers lits universitaires Organismes adultes / Gram négatif Conventionnels vs MALDI-TOF – fois par jour; ASP Oui Revolinksi en temps réel et autres Quasi expérimental NR Organismes adultes / Gram positifs Conventionnels vs BC-GP NR; prestataire et pharmacien Oui NR Roshdy et al Quasi-expérimental Centre médical académique NR / Streptococcus / Enterococcus spp Conventionnel vs BC-GP plus MALDI-TOF NR; pharmacien Oui NR Sango et al Quasi-expérimental Lits de centre médical universitaire NR / Enterococcus spp Conventionnel vs BC-GP ×; ASP Oui M-F; : am- pm Sothoron et al Quasi expérimental NR Organismes adultes / Gram négatif Conventionnels vs BC-GN ×; ASP Oui En temps réel Suzuki et al Quasi-expérimentaux Centres de soins tertiaires NR / Multiple conventionnel vs BC-GP / GN NR; médecin hospitalier et spécialiste des maladies infectieuses Oui NR Walker et al Quasi-expérimental Soins tertiaires lits hospitaliers et lits d’hôpitaux cancéreux NR / Organismes Gram négatif Conventionnels vs BC-GN ×; médecin si organisme résistant Oui Quotidien Wang et al Quasi-expérimental Soins tertiaires lits d’hôpitaux NR / Staphylococcus spp Convention vs PCR Une fois par jour; médecin Non NA Abréviations: ×, heures par jour, jours par semaine; ASP, programme de gestion des antimicrobiens; BC-GN, système de microréseau nanotechnologique à culture gram-négatif pour hémocultures; BC-GP, système de microréseau nanotechnologique à culture gram-positive pour hémocultures; BSI, infection sanguine; CoNS, espèce de Staphylococcus à coagulase négative; DSE, dossier de santé électronique; M-F, du lundi au vendredi; M-Sam, lundi-samedi; MALDI-TOF, analyse par temps de vol de désorption / ionisation laser assisté par matrice; mRDT, test de diagnostic rapide moléculaire; SARM, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline; NA, non applicable; NOS, échelle de Newcastle-Ottawa; NR, non rapporté; PCR, amplification en chaîne par polymérase; PNA-FISH, hybridation in situ fluorescente d’acide nucléique peptidique; ECR, essai contrôlé randomisé; Sam-Dim, Samedi et DimancheLes pratiques de laboratoire variaient selon les études, y compris les technologies mRDT utilisées, la fréquence des tests et les processus de déclaration. La PCR ou d’autres technologies de puces à ADN étaient les plus fréquemment utilisées; %, suivi de PNA-FISH de; % et analyse MALDI-TOF de; Une étude% a utilisé à la fois un système de microréseau nanotechnologique et une analyse confirmative MALDI-TOF Une distinction entre l’analyse MALDI-TOF des échantillons de sang directs et l’incubation de milieux solides pendant la nuit a été rapportée dans les études MALDI-TOF [,,,] étude unique signalant cette dernière méthode Parmi les études signalant la fréquence des tests d’échantillons de laboratoire,% ont signalé des tests en temps réel,% ont rapporté des essais par lots entre les périodes quotidiennes et% ont signalé des tests en temps réel pendant des périodes limitées. Parmi les études effectuant des heures de test en temps réel, un jour, jours par semaine ×, les notifications de résultats de mRDT ont été rapportées comme étant effectuées en temps réel pour des études alors que dans une autre étude le protocole exigeait seulement une notification en temps réel. si des gènes de résistance ont été détectés Enfin, les méthodes de notification ont également varié entre les études lorsqu’elles ont été rapportées, avec la majorité des études de rapports de; % de rapports directement à l’équipe ou au médecin principal et des études% rapportant aux résultats aux infirmières Les activités de l’ASA variaient selon l’étude La présence d’un ASP facilitant le mRDT représentait la majorité des données des études; % Dans les études rapportant les processus de notification ASP, seulement la moitié étaient en temps réel × Le reste avait défini des heures de réponse, par exemple, am à pm; Lundi-vendredi ou revue journalière des résultats Deux études , toutes deux quasi-expérimentales, ont explicitement indiqué si l’ASP était présent dans les deux périodes, avec ayant un ASP dans la période post-intervention seulement

Les résultats cliniques dans les bactériémies ont généralement favorisé le mRDT par rapport à la microbiologie conventionnelle. Figures et Parmi les études [,, -, -, -,,,, -], les OR pour le risque de mortalité étaient significativement plus faibles; % CI, -, donnant un nombre nécessaire à traiter de Stratification a révélé que les OR pour le risque de mortalité étaient significativement plus faibles pour les bactériémies à l’aide de mRDT avec ASP OR; % CI, – mais n’a pas réussi à atteindre l’importance sans le support de l’ASP; % CI, – Des résultats similaires ont été observés lorsqu’une analyse de sensibilité a été réalisée en utilisant des études qui contrôlaient les facteurs de confusion [,,,,,,] Lorsque le risque de mortalité était évalué par type d’organisme, il n’y avait pas de différence significative. parmi les isolats de levure OU; % CI, – En revanche, les probabilités de mortalité ont été réduites avec le mRDT dans les études sur la RO gram-négative; % CI, -, gram-positif; -, et les types d’organismes multiples; – Le risque de mortalité dans les essais de multiples organismes présentait une hétérogénéité significative. Cochran’s Q P =; I =% en raison d’une étude qui utilisait à la fois le test de sensibilité et le test de susceptibilité rapide. L’exclusion de cette étude a permis de réduire de% les probabilités de mortalité lors de tests sur des organismes multiples. % CI, -; Q P Cochran; I =% Analyse de sensibilité utilisant des études contrôlant pour la confusion [,,,,,], réductions non significatives du risque de mortalité pour chaque groupe d’organismes Figure complémentaire Méta-régressions des covariables par la présence d’un ASP P =, type d’organisme P =, réel Figure 5: Vue d’ensemble de la diapositiveTélécharger les résultats de mortalité avec le test de diagnostic rapide moléculaire versus le test conventionnel dans l’hémopathie Les rapports de cotes ont été déterminés avec l’aléa de Mantel-Haenszel. -effects method Abréviations: ASP, programme de gestion des antimicrobiens; CI, intervalle de confianceFigure View largeTélécharger la diapositive Résultats de mortalité avec test de diagnostic rapide moléculaire mRDT versus test conventionnel dans l’infection sanguine Rapports de cotes Les OR ont été déterminés avec la méthode des effets aléatoires de Mantel-Haenszel Abréviations: ASP, programme de gestion des antimicrobiens; IC, intervalle de confianceFigure View largeTélécharger la diapositiveMortalité avec test de diagnostic rapide moléculaire mRDT versus test conventionnel par type d’organisme dans l’infection sanguine Odds ratios ORs ont été déterminés avec la méthode des effets aléatoires de Mantel-Haenszel Abréviation: CI, intervalle de confianceFigure Voir grandTélécharger Comparaison de la mRDT et du test conventionnel par type d’organisme dans l’infection sanguine Rapports de cotes Les OR ont été déterminés avec la méthode des effets aléatoires de Mantel-Haenszel Abréviation: CI, intervalle de confiance

Parmi les études [,, -,,], le temps nécessaire pour obtenir une thérapie efficace a été significativement diminué par une différence moyenne pondérée de – heures% IC, – à – heures pour la mRDT versus la microbiologie conventionnelle Le temps de traitement efficace présentait une hétérogénéité significative QP de Cochran = ; I =% dû à une étude limitée aux entérocoques résistants à la vancomycine ERV L’exclusion de cette étude a donné lieu à un traitement efficace avec une différence moyenne pondérée diminuée de – heures% IC, – à – heures; Q P Cochran; I =% L’évaluation de cette étude et les données des sous-groupes d’ERV provenant d’études ont donné un temps de traitement efficace pondéré de la différence moyenne de – heures% IC, – à – heures; Q P Cochran; I =% Enfin, la figure supplémentaire du LOS était significativement plus courte avec mRDT, par jours – IC%, – et des résultats similaires ont été observés entre les sous-groupes par LOS hospitalière totale et par culture LOS L’analyse de sensibilité a été réalisée en utilisant les seules études qui contrôlait pour confondre et reflétait une perte de durée de vie réduite par une ADM de – jours% CI, – à jours; Q P & lt de Cochran; ; I =% Analyse du potentiel de biais de publication avec diagrammes en entonnoir Chiffres supplémentaires – aucun signe de biais de publication suggéré pour les analyses présentées dans les figures et Figure supplémentaire De même, les tests de régression d’Egger reflétaient une absence de biais de publication pour les analyses présentées dans les figures et et Figure supplémentaire P =, P =, et P = respectivement. Cependant, les résultats des tests de régression d’Egger ont suggéré un biais de publication possible avec l’analyse LOS Figure supplémentaire; P =

DISCUSSION

Les études sur les levures n’ont pas abouti à des réductions significatives de la mortalité. Cependant, parmi les études contrôlant les facteurs confusionnels [,,,,,,], non significatifs L’absence de démonstration du bénéfice du mRDT pour le risque de mortalité associé aux bactériémies de la levure ou entre les études de l’analyse de sensibilité peut refléter le nombre limité d’études et de tailles d’échantillon correspondantes. La détection de véritables bénéfices de mortalité peut être difficile en pré- Par conséquent, l’utilisation d’un résultat plus directement lié au mRDT, comme le délai d’un traitement efficace, peut être un meilleur indicateur des bienfaits de la MRDT. Bien que peu d’études aient rapporté le temps d’un traitement efficace, nous avons observé une diminution significative de ce paramètre Cependant, la distribution du temps L’importance de cette mesure a été démontrée dans une étude sur la bactériémie à ERV , dont les auteurs ont rapporté une augmentation de la mortalité journalière en l’absence d’un traitement efficace dans les premières heures de BSI et ont spéculé que Les TDR peuvent aider à réduire le temps nécessaire à une thérapie efficace dans le contexte de l’ERV Nos résultats suggèrent l’utilité particulière du mRDT dans les bactériémies à ERV, ce qui améliore le temps de traitement efficace par & gt; De plus, le temps moyen de traitement efficace de toutes les études ERV incluses dans notre analyse variait de quelques heures. Nous croyons donc que le mRDT peut avoir des effets bénéfiques chez les patients atteints de bactériémies ERV et peut aider à réduire le risque de mortalité dans cette population. LOS Bien que nous n’ayons pas évalué les coûts, les baisses observées dans LOS ont des implications significatives basées sur les économies de coûts par jour d’hospitalisation évitées. Une étude évaluant l’impact économique du mRDT dans BSI a démontré une économie de $ par patient après prise en compte des coûts mRDT. Cependant, la généralisation de la perte de DS signalée est probablement limitée aux grands hôpitaux et centres médicaux, car seules les études incluses ont été menées dans les hôpitaux communautaires. De plus, la LDV n’a pas permis de réduire significativement les études qui contrôlaient l’hétérogénéité significative dans cette analyse et la petite limite de l’échantillon Cette analyse systématique et cette méta-analyse présentent plusieurs limites. Pour la durée du séjour, notre analyse a suggéré un biais de publication possible. Cependant, ceci peut être lié au petit nombre d’études rapportant ce résultat. Bien que la généralisation de nos résultats cliniques puisse se limiter Il est à noter que dans ces études, malgré la présence d’un ASP, les pharmaciens non formés aux maladies infectieuses réagissaient aux bactériémies. Les études futures de l’hôpital communautaire définiraient les résultats aider à clarifier les meilleures pratiques dans ce domaine Les lignes directrices pour l’enregistrement et la communication de ces résultats lors de l’utilisation des TDR dans les BSI ont été décrites et devraient être utilisées par les chercheurs à l’avenir . variabilité dans les pratiques de laboratoire, telles que le dosage des dosages ou la performance de l’analyse MALDI-TOF, soit Les méthodes de notification des résultats du mRDT varient également, ce qui pourrait avoir des implications sur les résultats cliniques Bien que de futures évaluations puissent prendre en compte ces variations et leur relation avec les résultats cliniques, notre analyse soutient le mRDT en tant que groupe. améliore les résultats dans les BSI En outre, nous croyons que la mise en œuvre du mRDT devrait inclure un plan d’action pour assurer une interprétation correcte, des rapports en temps réel et des conseils sur le traitement optimal. En conclusion, le mRDT a été associé à des diminutions significatives du risque de mortalité en présence d’un ASP, mais pas en son absence. Des baisses significatives du risque de mortalité ont également été observées. pour des études incluant des organismes Gram positif, un organisme Gram négatif De plus, le TMD a été associé à une diminution du temps de traitement efficace et des DS. Le plus grand avantage du DRMT pour améliorer le temps de traitement efficace pourrait être les bactériémies causées par des organismes résistants, particulièrement les ERV. De même que des études supplémentaires expliquant les avantages des diverses technologies microbiologiques en combinaison avec ASP pour définir les meilleures pratiques. Sur la base des résultats cliniques, le mRDT devrait être considéré comme faisant partie de la norme de soins chez les patients atteints de bactériémies.

Données supplémentaires

Les documents supplémentaires sont disponibles à l’adresse http: // academicoupcom / cid Composé de données fournies par l’auteur au profit du lecteur, les documents publiés ne sont pas copiés et relèvent de la seule responsabilité de l’auteur, les questions ou commentaires doivent donc être adressés à l’auteur

Remarques

Avis de non-responsabilité Les opinions exprimées sont celles des auteurs et ne reflètent pas nécessairement la position ou la politique du Département des Anciens Combattants des États-Unis. Conflits d’intérêts potentiels EM a reçu une subvention institutionnelle via T Biosystems Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentiel Tous les auteurs ont soumis l’ICMJE Formulaire de divulgation des conflits d’intérêts potentiels Les conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués

Sylvie

Les commentaires sont fermés.