Tendances longitudinales de la résistance à la fluoroquinolone chez les isolats d’entérobactéries des patients hospitalisés et ambulatoires, -: Différences dans l’émergence et l’épidémiologie de la résistance à travers les organismes

Tendances longitudinales de la résistance à la fluoroquinolone chez les isolats d’entérobactéries des patients hospitalisés et ambulatoires, -: Différences dans l’émergence et l’épidémiologie de la résistance à travers les organismes

Nous avons mené une étude annuelle pour identifier et comparer les tendances de la prévalence annuelle de résistance aux fluoroquinolones FQ parmi les isolats d’Enterobacteriaceae obtenus des patients hospitalisés et ambulatoires dans notre système de soins de santé Un total d’isolats cliniques d’entérobactéries a été soumis à des tests de susceptibilité. pour toutes les Enterobacteriaceae, les tendances de résistance à la FQ différaient significativement entre les Enterobacteriaceae P & lt; Pour les isolats provenant de patients externes, seuls Escherichia coli et Proteus mirabilis ont montré des augmentations significatives de la résistance aux FQ P & lt; pour chaque tendance, la résistance à la FQ en consultation externe a également différé significativement entre les entérobactéries P & lt; Il existe des différences significatives entre les tendances des patients hospitalisés et ambulatoires FQ pour toutes les Enterobacteriaceae sauf P mirabilis et Enterobacter cloacae Bien que l’utilisation de certains antibiotiques à l’échelle de l’hôpital soit significativement corrélée avec la résistance aux FQ, ces corrélations diffèrent considérablement entre les organismes. identifier les cibles pour l’intervention doit reconnaître et tenir compte de la variabilité de la résistance à la FQ à travers les organismes et les milieux cliniques

Depuis leur introduction il y a ~ ans, les fluoroquinolones sont devenus l’une des classes d’agents les plus importantes de l’arsenal antimicrobien actuel . Les premières prévisions suggèrent que l’émergence d’une résistance aux FQ, en particulier chez les Enterobacteriaceae, est très improbable . l’émergence de résistance FQ chez les Enterobacteriaceae était très préoccupante, étant donné que ces agents pathogènes causent une proportion substantielle d’infections nosocomiales Bien que de récentes études de surveillance aient identifié la prévalence contemporaine de la résistance aux FQ , peu de données longitudinales existent. l’évolution de la résistance à la classe antimicrobienne FQ depuis l’introduction initiale de cette classe de médicaments antimicrobiens Caractérisation de ces tendances et de leur relation avec les modes d’utilisation des antimicrobiens, comparaison des tendances des patients hospitalisés et ambulatoires, et exploration de la variabilité de ces mesures entre différents Enterobacteriaceae sont v Afin de résoudre ce problème, nous avons réalisé une étude écologique pour identifier les tendances longitudinales de la susceptibilité FQ parmi les isolats d’Enterobacteriaceae obtenus à la fois des patients hospitalisés et des patients ambulatoires. Étudier les corrélations possibles entre l’utilisation annuelle à l’échelle de l’hôpital d’antibiotiques spécifiques ou de classes d’antibiotiques et la prévalence annuelle de la résistance à la FQ chez les isolats d’Enterobacteriaceae hospitalisés

Méthodes

laboratoire de microbiologie En outre, ce laboratoire traite et cultive des isolats ambulatoires pour le réseau de pratiques ambulatoires affiliés à l’Université de Pennsylvanie Système de santé UPHS Les pratiques ambulatoires UPHS comprennent à la fois cliniques et bureaux hospitaliers et les pratiques communautaires affiliées dans la région de Philadelphie note, tous les patients hospitalisés à HUP sont des adultes, mais ~% des patients ambulatoires UPHS sont des personnes & lt; Toutes les entérobactéries isolées des patients hospitalisés et ambulatoires pendant la période d’étude ont été identifiées grâce aux dossiers du laboratoire de microbiologie clinique et ont été incluses dans l’étude. Méthodes microbiologiques Nous avons concentré notre étude sur la résistance FQ aux entérobactéries les plus isolées dans notre établissement: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Enterobacter cloacae, Enterobacter aerogenes et Serratia marcescens. Tous les isolats cliniques de ces organismes collectés au cours de la période d’étude – ont été inclus dans l’étude et ont été classés par année de collecte et par patient hospitalisé ou ambulatoire Si le même organisme a été identifié sur & gt; Tous les échantillons cliniques obtenus durant la période d’étude ont été traités et cultivés dans un laboratoire central de microbiologie clinique. Les entérobactéries ont été identifiées par des méthodes conventionnelles et les susceptibilités antimicrobiennes ont été déterminées selon des critères établis Avant mai, le système Vitek bioMérieux était la principale méthode de test de sensibilité Après cette période, le laboratoire a changé pour les panneaux conventionnels Microscan qui ont été lus sur le MicroScan Walkaway Dade Behring, les agents suivants ont été utilisés comme marqueurs de susceptibilité FQ à différentes périodes du étude: ciprofloxacine -, ofloxacine -, et lévofloxacine – Un organisme était considéré comme résistant à la FQ si la CMI de la ciprofloxacine était de ⩾ μg / mL ou la CMI de l’ofloxacine ou de la lévofloxacine était de ⩾ μg / mL.L’utilisation des agents antimicrobiens documenté: vancomycine, c de dernière génération éphalosporines, par exemple, ceftazidime, ceftriaxone et céfépime, fluoroquinolones c.-à-d., ciprofloxacine, ofloxacine et lévofloxacine, nafcilline, inhibiteurs de β-lactam / β-lactamase ampicilline / sulbactam, amoxicilline / clavulanate et ticarcilline / clavulanate, imipénème, triméthoprime-sulfaméthoxazole, aminoglycosides c’est-à-dire, la gentamicine, la nétilmicine, l’amikacine, la tobramycine, la clindamycine, le métronidazole et le chloramphénicol. Notons que le FQ primaire sur le formulaire hospitalier différait au cours de la période d’étude: ciprofloxacine, -; ofloxacine, -; lévofloxacine, – Dans chacune de ces périodes, le FQ du formulaire primaire représentait>% de tous les FQ. L’utilisation d’antimicrobiens était décrite comme des doses quotidiennes définies. DDD par patient-jourAnalyse statistique La prévalence annuelle de la résistance FQ était calculée comme le pourcentage annuel de Tous les organismes identifiés dans le laboratoire de microbiologie clinique présentant une résistance aux FQ Ce pourcentage a été calculé séparément pour chaque organisme d’intérêt et séparément pour les isolats hospitaliers et ambulatoires de chaque organismePour évaluer la tendance de la proportion de résultats positifs au fil du temps, tendance Cochran-Armitage Pour déterminer si les tendances de la résistance FQ différaient entre les Enterobacteriaceae, nous avons effectué une analyse de régression logistique avec la résistance FQ comme variable dépendante et l’année civile et l’organisme comme variables indépendantes. Pour déterminer si les tendances de la résistance FQ différaient entre les paramètres des patients hospitalisés et ambulatoires, nous co Nous avons réalisé une analyse de régression logistique avec la résistance FQ comme variable dépendante et année civile et groupe de patients ie, patient hospitalisé vs patient externe comme variables indépendantes Cette analyse a été réalisée séparément pour chaque organisme d’intérêtPour chaque organisme, nous avons étudié s’il existait une corrélation entre la prévalence annuelle Un coefficient de corrélation de rang de Spearman a été calculé pour évaluer la relation entre l’utilisation des antimicrobiens et la prévalence annuelle de la résistance aux FQ chez les patients hospitalisés pour lesquels la prévalence annuelle de la résistance aux FQ était corrélé avec & gt; agent antimicrobien, un coefficient de corrélation partielle a été calculé pour identifier des corrélations indépendantes entre l’utilisation d’agents antimicrobiens spécifiques et la prévalence de la résistance FQ Pour chaque organisme, tous les agents antimicrobiens pour lesquels l’utilisation a été corrélée avec la résistance FQ ; ont été inclus dans l’analyse de corrélation partielle pour cet organismeUn niveau de signification de -sided a été utilisé pour tous les tests Les analyses statistiques ont été effectuées en utilisant des programmes standard dans le logiciel Stata, la version Stata et le logiciel StatXact, version Cytel

Résultats

Au total, des isolats cliniques d’entérobactéries ont été soumis à des tests de sensibilité au cours de la période d’étude – Parmi ceux-ci, des isolats ont été obtenus chez des patients hospitalisés Le nombre moyen d’isolats hospitalisés testés était le suivant: E coli, K pneumoniae, gamme, -; P mirabilis, gamme, -; E cloacae, gamme, -; E aerogenes, gamme, -; S marcescens, gamme, – Pour tous ces organismes, il y avait des tendances significatives à la hausse de la résistance aux FQ des patients hospitalisés au cours de la période d’étude P, par test de tendance: E coli, P & lt; ; K pneumoniae, P & lt; ; P mirabilis, P & lt; ; E cloacae, P =; E aerogenes, P =; S marcescens, P & lt; figures – Cependant, la tendance à l’augmentation de la résistance à la FQ différait significativement parmi les Enterobacteriaceae étudiées P & lt;

Figure Vue largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats d’Escherichia coli obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoiresFigure View largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats d’Escherichia coli obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoires

Figure Vue largeTélécharger diapositives dans la résistance FQ fluoroquinolone parmi les isolats de Serratia marsescens obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir des patients ambulatoiresFigure vue largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats de Serratia marsescens obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoires Des tendances significatives à la hausse ont également été observées pour chaque organisme lorsque les isolats obtenus à partir d’échantillons urinaires et d’échantillons non urinaires ont été étudiés séparément Les seules exceptions étaient les isolats E aerogenes de l’urine P =, par test de tendance, Isolats d’E cloacae provenant d’échantillons nonurins P =, par test de tendance, et P mirabilis isolats d’échantillons nonurinus P =, par test de tendanceOf, isolats totaux,,% proviennent de patients ambulatoires Le nombre moyen d’isolats ambulatoires testés par an est le suivant : E coli, gamme, -; K pneumoniae, gamme, -; P mirabilis, gamme, -; E cloacae, gamme, -; E aerogenes, gamme, -; S marcescens, gamme, – Parmi ces organismes, seuls E coli et P mirabilis ont montré des tendances significatives à la hausse de la résistance à la FQ chez les patients ambulatoires au cours de la période d’étude P & lt; pour chaque, par test pour les chiffres de tendance – Encore une fois, les tendances de la résistance à la FQ chez les patients externes ont différé significativement entre les entérobactéries étudiées P & lt; Des tendances similaires dans la résistance à la FQ ont été observées lorsque des isolats de chaque organisme provenant d’échantillons d’urines ambulatoires et d’échantillons non urinaires ont été étudiés séparément Pour E. coli, des isolats provenant d’échantillons urinaires et non urinaires ont montré des tendances significatives croissantes. pour chacun, en testant la tendance de P mirabilis, des isolats provenant à la fois d’échantillons d’urine et de non-urine ont montré des tendances significatives croissantes de résistance à la FQ P & lt; En revanche, pour les autres organismes, aucun des isolats provenant d’échantillons d’urine et de nonurine provenant de patients ambulatoires n’a montré de tendances significatives à la résistance aux FQ. Les tendances longitudinales de la résistance FQ pour les isolats d’E. coli des patients hospitalisés et ambulatoires ont été significativement différentes P & lt; De même, comme le montre la figure, il existait des différences significatives lorsqu’on comparait les tendances de la résistance FQ pour les isolats de K pneumoniae des patients hospitalisés et ambulatoires. P = Cependant, des analyses similaires pour P mirabilis et E cloacae n’ont pas révélé de différences significatives pour les patients hospitalisés et ambulatoires P = et P = respectivement, et enfin, comme démontré dans les figures et, pour E aerogenes et S marcescens, il y avait des différences significatives dans les tendances de résistance FQ pour les patients hospitalisés et ambulatoires P & lt; et P =, respectivement

Figure Vue largeTélécharger diapositives dans la résistance FQ fluoroquinolone parmi les isolats de Klebsiella pneumoniae obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoiresFigure View largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats de Klebsiella pneumoniae obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoires

Figure Vue largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats de Proteus mirabilis obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoiresFigure View largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats de Proteus mirabilis obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoires

Figure Vue largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats Enterobacter cloacae obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir des patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoiresFigure View largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats Enterobacter cloacae obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoires

Figure Vue largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats d’Enterobacter aerogenes obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoiresFigure vue largeTélécharger diapositives dans la résistance à la fluoroquinolone FQ parmi les isolats d’Enterobacter aerogenes obtenus à partir de patients hospitalisés et ambulatoires, – Les barres montrent% CIs Ipt, isolats obtenus à partir de patients hospitalisés; Opt, isolats obtenus à partir de patients ambulatoiresIl y avait des antibiotiques ou des classes d’antibiotiques pour lesquels l’utilisation significativement corrélée avec le pourcentage annuel de résistance aux FQ hospitalisés pour ⩾ de la table Enterobacteriaceae étudiée Cependant, les agents pour lesquels l’utilisation corrélée à la résistance FQ différaient considérablement entre les organismes. une large utilisation de FQ et de clindamycine corrélée avec la résistance FQ pour les organismes, et l’utilisation de chloramphénicol corrélée avec la résistance FQ pour les Enterobacteriaceae étudiés. Pour E cloacae et E aerogenes, il n’y avait pas d’agents antimicrobiens corrélés avec la résistance aux FQ P & lt; et P =, respectivement, par test de tendance Après avoir calculé des coefficients de corrélation partielle pour contrôler simultanément les tendances avec plusieurs antibiotiques, il restait une corrélation significative limite entre la résistance FQ et l’utilisation des deux FQ r =; P = et chloramphenicol r =; P = dans les isolats d’E. Coli obtenus à partir de l’utilisation de la FQ chez les patients hospitalisés, a également conservé une corrélation indépendante significative et limite avec la résistance FQ chez les isolats de K pneumoniae r =; P = Pour les isolats de S marcescens, la clindamycine était le seul agent dont l’utilisation était indépendamment corrélée avec la résistance FQ r =; P = Pour les isolats P mirabilis, E cloacae et E aerogenes, il n’y avait pas d’agents antimicrobiens dont l’utilisation était corrélée de façon indépendante avec la résistance FQ

Table View largeTéléchargerCorrelation de l’utilisation des antimicrobiens à l’échelle de l’hôpital avec la résistance aux fluoroquinolones chez les espèces d’isolats d’Enterobacteriaceae provenant de la population hospitalisée de l’hôpital de l’Université de Pennsylvanie, -Table View largeTéléchargement de l’utilisation des antimicrobiens à l’échelle hospitalière avec résistance aux fluoroquinolones d’isolats d’Enterobacteriaceae obtenus de la population hospitalisée de l’hôpital de l’Université de Pennsylvanie, –

Discussion

On a noté que les microorganismes ayant des CMI intrinsèques plus élevées nécessitent moins de mutations par résistance graduelle et, théoriquement, une pression moins sélective de l’exposition aux antibiotiques pour présenter une résistance phénotypique Bien que les entérobactéries les plus communes aient des CMI intrinsèques faibles. En outre, un rapport récent a noté que, contrairement à toutes les autres Enterobacteriaceae analysées à ce jour, l’acquisition de la résistance à la FQ dans les isolats cliniques de l’espèce était plus fréquente chez les espèces Enterobacter et S marcescens. P mirabilis implique fréquemment une mutation de gyrB Une recherche supplémentaire pour déterminer si une telle variabilité dans l’acquisition des déterminants de la résistance FQ pourrait aider à expliquer les différences d’émergence de la résistance FQ à travers les entérobactéries est justifiée. Nos résultats suggèrent également que les facteurs de , à ce jour, les études investissent Les études cliniques futures devraient comparer l’épidémiologie de la résistance FQ à toutes les entérobactéries. ont noté des différences significatives dans les tendances de résistance à la FQ en comparant des isolats du même organisme obtenus à partir de patients hospitalisés avec ceux obtenus à partir de patients ambulatoires Les études antérieures ont typiquement noté des taux plus élevés de résistance FQ dans les isolats E coli obtenus en milieu hospitalier lire la description. Bien que cet écart puisse s’expliquer en partie par des différences dans l’ampleur ou l’intensité de l’utilisation de la FQ dans ces milieux, l’utilisation de la FQ est très fréquente chez les patients hospitalisés et ambulatoires Il est également possible que les patients Pathogènes résistants à la FQ pendant l’hospitalisation Les comparaisons futures de l’épidémiologie de la résistance à la FQ chez les patients hospitalisés et chez les patients ambulatoires seraient très utiles pour déterminer les facteurs responsables de la variabilité des tendances de la résistance aux FQ dans ces milieux. Plusieurs limites potentielles à notre étude La nature écologique de notre étude, avec le manque de données individuelles, limite la mesure dans laquelle les inférences causales peuvent être tirées et rend le contrôle de la confusion plus difficile . En outre, notre analyse des corrélations entre L’utilisation d’antimicrobiens à l’échelle de l’hôpital et la prévalence annuelle de la résistance FQ étaient limitées par la petite taille de l’échantillon, étant donné que nous étions limités à des unités d’observation, soit des années d’étude. déterminer si nos résultats étaient dus à la présence de plusieurs str En outre, notre protocole de test de sensibilité a changé. Cependant, les augmentations les plus significatives de la résistance FQ ont eu lieu depuis, et le protocole de test de sensibilité n’a pas été modifié au cours de cette période. Notre étude a été menée dans un Enfin, la comparaison des tendances de la résistance aux FQ chez les patients hospitalisés et ambulatoires peut ne pas être valable si ces populations sont significativement différentes Étant donné la nature écologique de cette étude, des données limitées sont disponibles En ce qui concerne ces populations Toutefois, selon les données du recensement américain, la population qui sert de principale zone de service du HUP est ~% afro-américaine et% blanche, et% de la population est une femme En comparaison,% de la population desservie par le réseau UPHS des pratiques ambulatoires chez les Afro-Américains,% étaient blancs, et% étaient des femmes La similitude raisonnable entre La répartition par sexe et par race de la population du réseau ambulatoire de l’UPHS et celle des données du recensement de la zone de couverture locale du HUP indiquent que la plupart des cabinets ambulatoires de l’UPHS sont situés à proximité du HUP et tirent leurs patients de cette région urbaine. Ces données mettent en évidence l’importance d’identifier des stratégies pour préserver l’utilité de ces agents. Bien que la résistance à la FQ ait augmenté de façon marquée chez les Enterobacteriaceae, des différences significatives dans l’émergence de la résistance à la FQ ont été notées chez les Enterobacteriaceae. Les efforts pour élucider l’épidémiologie de la résistance à la FQ, prédire les futurs profils de résistance à la FQ et identifier les cibles potentielles d’intervention doivent reconnaître et tenir compte de la variabilité de la résistance FQ entre les organismes et les milieux cliniques

Sylvie

Les commentaires sont fermés.